MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011981	GC	3	6	91938	91943	0 %	0 %	50 %	50 %	222102496
1502	NC_011981	CAT	2	6	91944	91949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102496
1503	NC_011981	AGGC	2	8	92060	92067	25 %	0 %	50 %	25 %	222102496
1504	NC_011981	GTC	2	6	92152	92157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102496
1505	NC_011981	GCG	2	6	92206	92211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102496
1506	NC_011981	GGC	2	6	92220	92225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102496
1507	NC_011981	TCT	2	6	92255	92260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102496
1508	NC_011981	ACG	2	6	92440	92445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102496
1509	NC_011981	TCG	2	6	92532	92537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102496
1510	NC_011981	TCGA	2	8	92542	92549	25 %	25 %	25 %	25 %	222102496
1511	NC_011981	CTT	2	6	92652	92657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102496
1512	NC_011981	C	6	6	92669	92674	0 %	0 %	0 %	100 %	222102496
1513	NC_011981	TCG	2	6	92866	92871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102497
1514	NC_011981	AG	3	6	92906	92911	50 %	0 %	50 %	0 %	222102497
1515	NC_011981	ATCT	2	8	92955	92962	25 %	50 %	0 %	25 %	222102497
1516	NC_011981	GC	3	6	92965	92970	0 %	0 %	50 %	50 %	222102497
1517	NC_011981	ATG	2	6	92980	92985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102497
1518	NC_011981	GC	3	6	93057	93062	0 %	0 %	50 %	50 %	222102497
1519	NC_011981	TCA	2	6	93241	93246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102497
1520	NC_011981	TTGCCG	2	12	93462	93473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102498
1521	NC_011981	GTG	2	6	93488	93493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102498
1522	NC_011981	CG	3	6	93562	93567	0 %	0 %	50 %	50 %	222102498
1523	NC_011981	CG	3	6	93584	93589	0 %	0 %	50 %	50 %	222102498
1524	NC_011981	ACTCG	2	10	93616	93625	20 %	20 %	20 %	40 %	222102498
1525	NC_011981	CCTG	2	8	93652	93659	0 %	25 %	25 %	50 %	222102498
1526	NC_011981	GGC	2	6	93764	93769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102498
1527	NC_011981	TCT	2	6	93826	93831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102498
1528	NC_011981	GTG	2	6	93874	93879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102498
1529	NC_011981	CCA	2	6	93885	93890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102498
1530	NC_011981	GAG	2	6	93936	93941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102498
1531	NC_011981	CGT	2	6	93973	93978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102498
1532	NC_011981	TGG	2	6	94498	94503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102499
1533	NC_011981	TAA	2	6	94606	94611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102499
1534	NC_011981	TGT	2	6	94633	94638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102499
1535	NC_011981	AGC	2	6	94689	94694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102499
1536	NC_011981	GAA	2	6	94787	94792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102499
1537	NC_011981	GCG	2	6	94800	94805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102499
1538	NC_011981	GCG	2	6	94969	94974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102499
1539	NC_011981	CTT	2	6	95101	95106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102499
1540	NC_011981	CGGA	2	8	95258	95265	25 %	0 %	50 %	25 %	222102500
1541	NC_011981	GC	4	8	95272	95279	0 %	0 %	50 %	50 %	222102500
1542	NC_011981	GAT	2	6	95365	95370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102500
1543	NC_011981	CGC	2	6	95461	95466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102500
1544	NC_011981	ATG	2	6	95470	95475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102500
1545	NC_011981	GA	3	6	95484	95489	50 %	0 %	50 %	0 %	222102500
1546	NC_011981	ACC	2	6	95537	95542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102500
1547	NC_011981	GGTTG	2	10	95578	95587	0 %	40 %	60 %	0 %	222102500
1548	NC_011981	GTC	2	6	95626	95631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102500
1549	NC_011981	AGC	2	6	95642	95647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102500
1550	NC_011981	GAT	2	6	95698	95703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102500
1551	NC_011981	CGC	2	6	95706	95711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102500
1552	NC_011981	T	6	6	95888	95893	0 %	100 %	0 %	0 %	222102501
1553	NC_011981	CGT	2	6	95908	95913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102501
1554	NC_011981	GCA	2	6	95949	95954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102501
1555	NC_011981	GCT	2	6	96045	96050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102501
1556	NC_011981	CGT	2	6	96068	96073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102501
1557	NC_011981	GCC	2	6	96077	96082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102501
1558	NC_011981	CAA	2	6	96090	96095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102501
1559	NC_011981	CAT	2	6	96144	96149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102501
1560	NC_011981	ATA	2	6	96495	96500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102502
1561	NC_011981	AGC	2	6	96583	96588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102502
1562	NC_011981	CTC	2	6	96789	96794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102502
1563	NC_011981	ATA	2	6	96820	96825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102502
1564	NC_011981	GGT	2	6	96927	96932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102502
1565	NC_011981	ACC	2	6	97021	97026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102502
1566	NC_011981	GGCAA	2	10	97104	97113	40 %	0 %	40 %	20 %	222102502
1567	NC_011981	GCT	2	6	97143	97148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102502
1568	NC_011981	GCG	2	6	97149	97154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102502
1569	NC_011981	GTTTG	2	10	97163	97172	0 %	60 %	40 %	0 %	222102502
1570	NC_011981	TGA	2	6	97198	97203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102502
1571	NC_011981	CCG	2	6	97208	97213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102502
1572	NC_011981	CA	4	8	97221	97228	50 %	0 %	0 %	50 %	222102502
1573	NC_011981	TGC	3	9	97263	97271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102502
1574	NC_011981	TCT	2	6	97305	97310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102502
1575	NC_011981	CCG	2	6	97507	97512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102503
1576	NC_011981	GCA	2	6	97552	97557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1577	NC_011981	TGG	2	6	97569	97574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102503
1578	NC_011981	TCA	2	6	97617	97622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102503
1579	NC_011981	CAG	2	6	97651	97656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1580	NC_011981	GCG	2	6	97692	97697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102503
1581	NC_011981	CTG	2	6	97740	97745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1582	NC_011981	CACC	2	8	97749	97756	25 %	0 %	0 %	75 %	222102503
1583	NC_011981	ACA	2	6	97764	97769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102503
1584	NC_011981	GGCAAT	2	12	97798	97809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222102503
1585	NC_011981	GCA	2	6	97937	97942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1586	NC_011981	CAG	2	6	98026	98031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1587	NC_011981	GCG	2	6	98129	98134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102503
1588	NC_011981	TGC	2	6	98163	98168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102503
1589	NC_011981	CAC	2	6	98218	98223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102503
1590	NC_011981	ATG	2	6	98243	98248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102503
1591	NC_011981	CAT	2	6	98263	98268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102503
1592	NC_011981	TGCC	2	8	98326	98333	0 %	25 %	25 %	50 %	222102503
1593	NC_011981	AGAT	2	8	98381	98388	50 %	25 %	25 %	0 %	222102503
1594	NC_011981	TCA	2	6	98412	98417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102503
1595	NC_011981	CGC	2	6	98505	98510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102503
1596	NC_011981	CCA	2	6	98511	98516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102503
1597	NC_011981	GCGA	2	8	98567	98574	25 %	0 %	50 %	25 %	222102503
1598	NC_011981	CCAG	2	8	98595	98602	25 %	0 %	25 %	50 %	222102503
1599	NC_011981	AGA	2	6	98658	98663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102503
1600	NC_011981	TCA	2	6	98756	98761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102504
1601	NC_011981	CGG	2	6	98776	98781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102504
1602	NC_011981	GCT	2	6	98813	98818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102504
1603	NC_011981	CCA	3	9	98840	98848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102504
1604	NC_011981	CGTC	2	8	98884	98891	0 %	25 %	25 %	50 %	222102504
1605	NC_011981	CAC	2	6	98901	98906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102504
1606	NC_011981	GCC	2	6	98910	98915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102504
1607	NC_011981	CGC	2	6	98952	98957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102504
1608	NC_011981	CA	3	6	98990	98995	50 %	0 %	0 %	50 %	222102504
1609	NC_011981	GGC	2	6	99014	99019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102504
1610	NC_011981	AGCG	2	8	99094	99101	25 %	0 %	50 %	25 %	222102504
1611	NC_011981	AATC	2	8	99132	99139	50 %	25 %	0 %	25 %	222102504
1612	NC_011981	TGA	2	6	99299	99304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102504
1613	NC_011981	GTT	2	6	99385	99390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102504
1614	NC_011981	TGC	2	6	99402	99407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102504
1615	NC_011981	TCC	2	6	99415	99420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102504
1616	NC_011981	AGC	2	6	99435	99440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102504
1617	NC_011981	GCA	2	6	99457	99462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102504
1618	NC_011981	T	6	6	99506	99511	0 %	100 %	0 %	0 %	222102504
1619	NC_011981	GCC	2	6	99517	99522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102504
1620	NC_011981	CGG	3	9	99590	99598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102504
1621	NC_011981	ATG	2	6	99610	99615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102504
1622	NC_011981	ATCAC	2	10	99809	99818	40 %	20 %	0 %	40 %	222102505
1623	NC_011981	GGC	2	6	99844	99849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102505
1624	NC_011981	CGCA	2	8	99938	99945	25 %	0 %	25 %	50 %	222102505
1625	NC_011981	TGCC	2	8	99960	99967	0 %	25 %	25 %	50 %	222102505
1626	NC_011981	CCA	2	6	100047	100052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102505
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1628	NC_011981	GCC	3	9	100202	100210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102505
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1630	NC_011981	GCT	2	6	100278	100283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102505
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1652	NC_011981	TGG	2	6	101344	101349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102506
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1665	NC_011981	GTC	2	6	102319	102324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102507
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1744	NC_011981	GCG	2	6	106557	106562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102511
1745	NC_011981	ATG	2	6	106581	106586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102511
1746	NC_011981	CTT	2	6	106588	106593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102511
1747	NC_011981	CGC	2	6	106609	106614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102511
1748	NC_011981	GGC	2	6	106648	106653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102511
1749	NC_011981	TGC	2	6	106722	106727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102511
1750	NC_011981	TTG	2	6	106737	106742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102511
1751	NC_011981	CTG	2	6	106769	106774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102511
1752	NC_011981	TCG	2	6	106796	106801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102511
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1766	NC_011981	ATG	2	6	107331	107336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102512
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1769	NC_011981	GAT	2	6	107467	107472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102512
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1775	NC_011981	TGC	2	6	107790	107795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102512
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1779	NC_011981	TG	3	6	108068	108073	0 %	50 %	50 %	0 %	222102512
1780	NC_011981	GACA	2	8	108110	108117	50 %	0 %	25 %	25 %	222102512
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1785	NC_011981	GTG	2	6	108299	108304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102512
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1837	NC_011981	CTG	2	6	113011	113016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102518
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1850	NC_011981	CAT	2	6	114930	114935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102520
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1862	NC_011981	A	6	6	115999	116004	100 %	0 %	0 %	0 %	222102521
1863	NC_011981	CAA	2	6	116033	116038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102521
1864	NC_011981	TGT	2	6	116129	116134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102521
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1868	NC_011981	CAA	2	6	116329	116334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102521
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1988	NC_011981	CGC	2	6	124363	124368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102528
1989	NC_011981	TTGA	2	8	124412	124419	25 %	50 %	25 %	0 %	222102528
1990	NC_011981	CAC	2	6	124451	124456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102528
1991	NC_011981	GCC	2	6	124532	124537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102528
1992	NC_011981	GCT	2	6	124602	124607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102529
1993	NC_011981	GGCA	2	8	124608	124615	25 %	0 %	50 %	25 %	222102529
1994	NC_011981	TGCC	2	8	124742	124749	0 %	25 %	25 %	50 %	222102529
1995	NC_011981	TGCCAT	2	12	124791	124802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222102529
1996	NC_011981	TGC	2	6	124814	124819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102529
1997	NC_011981	AACC	2	8	124827	124834	50 %	0 %	0 %	50 %	222102529
1998	NC_011981	TGG	2	6	124880	124885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102529
1999	NC_011981	TTG	2	6	125018	125023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102529
2000	NC_011981	CTG	2	6	125035	125040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102529

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